Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Rab11fip3Q8CHD8 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Rab11fip3Q8CHD8 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Rab11fip3Q8CHD8 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Rab11fip3Q8CHD8 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Rab11fip3Q8CHD8 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Rab11fip3Q8CHD8 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Rab11fip3Q8CHD8 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Rab11fip3Q8CHD8 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Rab11fip3Q8CHD8 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Rab11fip3Q8CHD8 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
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