Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Snx8Q8CFD4 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms