Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp27Q8CEG8 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms