Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufl1Q8CCJ3 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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