Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Ccdc113Q8C5T8 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Ccdc113Q8C5T8 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Ccdc113Q8C5T8 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Ccdc113Q8C5T8 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Ccdc113Q8C5T8 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Ccdc113Q8C5T8 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Ccdc113Q8C5T8 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Ccdc113Q8C5T8 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Ccdc113Q8C5T8 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Ccdc113Q8C5T8 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Ccdc113Q8C5T8 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc113Q8C5T8 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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