Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3W1

Uncharacterized protein C1orf198 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C3W1 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3W1 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3W1 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Q8C3W1 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3W1 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3W1 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q8C3W1 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q8C3W1 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms