Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1C8

Pnma1, Paraneoplastic antigen Ma1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma1Q8C1C8 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnma1Q8C1C8 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnma1Q8C1C8 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnma1Q8C1C8 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnma1Q8C1C8 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnma1Q8C1C8 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnma1Q8C1C8 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnma1Q8C1C8 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnma1Q8C1C8 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnma1Q8C1C8 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnma1Q8C1C8 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnma1Q8C1C8 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnma1Q8C1C8 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnma1Q8C1C8 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnma1Q8C1C8 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnma1Q8C1C8 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnma1Q8C1C8 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnma1Q8C1C8 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnma1Q8C1C8 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnma1Q8C1C8 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnma1Q8C1C8 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnma1Q8C1C8 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnma1Q8C1C8 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnma1Q8C1C8 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnma1Q8C1C8 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pnma1Q8C1C8 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pnma1Q8C1C8 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms