Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX32

Slx1b, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx1bQ8BX32 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slx1bQ8BX32 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms