Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Ctdsp2Q8BX07 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Ctdsp2Q8BX07 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Ctdsp2Q8BX07 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Ctdsp2Q8BX07 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Ctdsp2Q8BX07 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Ctdsp2Q8BX07 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Ctdsp2Q8BX07 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Ctdsp2Q8BX07 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Ctdsp2Q8BX07 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Ctdsp2Q8BX07 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Ctdsp2Q8BX07 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Ctdsp2Q8BX07 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Ctdsp2Q8BX07 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Ctdsp2Q8BX07 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Ctdsp2Q8BX07 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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