Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms