Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pggt1bQ8BUY9 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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