Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKU8

Tmem87b, Transmembrane protein 87B, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem87bQ8BKU8 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem87bQ8BKU8 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem87bQ8BKU8 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem87bQ8BKU8 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem87bQ8BKU8 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem87bQ8BKU8 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem87bQ8BKU8 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem87bQ8BKU8 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem87bQ8BKU8 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem87bQ8BKU8 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem87bQ8BKU8 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem87bQ8BKU8 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem87bQ8BKU8 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem87bQ8BKU8 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem87bQ8BKU8 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem87bQ8BKU8 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem87bQ8BKU8 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem87bQ8BKU8 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem87bQ8BKU8 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem87bQ8BKU8 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms