Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJU2

Tspan9, Tetraspanin-9, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan9Q8BJU2 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tspan9Q8BJU2 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms