Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
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Ubash3bQ8BGG7 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubash3bQ8BGG7 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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