Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms