Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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SnupnQ80W37 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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SnupnQ80W37 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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SnupnQ80W37 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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SnupnQ80W37 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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SnupnQ80W37 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
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SnupnQ80W37 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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SnupnQ80W37 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SnupnQ80W37 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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