Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms