Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Actn1Q7TPR4 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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