Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Tmeff1Q6PFE7 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Tmeff1Q6PFE7 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Tmeff1Q6PFE7 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Tmeff1Q6PFE7 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Tmeff1Q6PFE7 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Tmeff1Q6PFE7 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Tmeff1Q6PFE7 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Tmeff1Q6PFE7 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Tmeff1Q6PFE7 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Tmeff1Q6PFE7 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmeff1Q6PFE7 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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