Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp49Q6P9L4 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Usp49Q6P9L4 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Usp49Q6P9L4 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Usp49Q6P9L4 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Usp49Q6P9L4 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Usp49Q6P9L4 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Usp49Q6P9L4 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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