Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CltbQ6IRU5 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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