Protein–RNA interactions for Protein: Q64705

Usf2, Upstream stimulatory factor 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf2Q64705 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Gm45191-201ENSMUST00000205846 5439 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Usf2Q64705 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usf2Q64705 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms