Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprdQ64487 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms