Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Clcn1Q64347 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms