Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc18Q640L5 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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