Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sall3Q62255 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms