Protein–RNA interactions for Protein: Q62147

Sspn, Sarcospan, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SspnQ62147 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SspnQ62147 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SspnQ62147 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SspnQ62147 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SspnQ62147 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SspnQ62147 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SspnQ62147 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SspnQ62147 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SspnQ62147 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SspnQ62147 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SspnQ62147 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SspnQ62147 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SspnQ62147 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SspnQ62147 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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SspnQ62147 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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SspnQ62147 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SspnQ62147 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SspnQ62147 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SspnQ62147 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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