Protein–RNA interactions for Protein: Q60987

Foxg1, Forkhead box protein G1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxg1Q60987 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Foxg1Q60987 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Foxg1Q60987 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Foxg1Q60987 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Foxg1Q60987 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Foxg1Q60987 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Foxg1Q60987 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Foxg1Q60987 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Foxg1Q60987 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Foxg1Q60987 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Foxg1Q60987 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Foxg1Q60987 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Foxg1Q60987 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Foxg1Q60987 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Foxg1Q60987 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Foxg1Q60987 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Foxg1Q60987 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Foxg1Q60987 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Foxg1Q60987 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Foxg1Q60987 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Foxg1Q60987 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Foxg1Q60987 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Foxg1Q60987 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Foxg1Q60987 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Foxg1Q60987 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Foxg1Q60987 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Foxg1Q60987 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Foxg1Q60987 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms