Protein–RNA interactions for Protein: Q60848

Hells, Lymphocyte-specific helicase, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HellsQ60848 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HellsQ60848 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HellsQ60848 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HellsQ60848 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HellsQ60848 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HellsQ60848 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HellsQ60848 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HellsQ60848 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HellsQ60848 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HellsQ60848 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HellsQ60848 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
HellsQ60848 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HellsQ60848 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HellsQ60848 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HellsQ60848 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HellsQ60848 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HellsQ60848 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
HellsQ60848 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HellsQ60848 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HellsQ60848 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HellsQ60848 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HellsQ60848 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HellsQ60848 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HellsQ60848 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HellsQ60848 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HellsQ60848 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HellsQ60848 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HellsQ60848 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HellsQ60848 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HellsQ60848 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HellsQ60848 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HellsQ60848 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HellsQ60848 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HellsQ60848 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HellsQ60848 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HellsQ60848 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HellsQ60848 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HellsQ60848 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HellsQ60848 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HellsQ60848 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HellsQ60848 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HellsQ60848 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HellsQ60848 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HellsQ60848 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HellsQ60848 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HellsQ60848 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HellsQ60848 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HellsQ60848 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HellsQ60848 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HellsQ60848 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HellsQ60848 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HellsQ60848 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HellsQ60848 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HellsQ60848 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HellsQ60848 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HellsQ60848 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HellsQ60848 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HellsQ60848 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HellsQ60848 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HellsQ60848 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HellsQ60848 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HellsQ60848 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HellsQ60848 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HellsQ60848 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HellsQ60848 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HellsQ60848 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HellsQ60848 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HellsQ60848 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HellsQ60848 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HellsQ60848 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HellsQ60848 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HellsQ60848 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HellsQ60848 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HellsQ60848 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HellsQ60848 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HellsQ60848 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HellsQ60848 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HellsQ60848 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HellsQ60848 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HellsQ60848 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HellsQ60848 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HellsQ60848 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HellsQ60848 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HellsQ60848 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HellsQ60848 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HellsQ60848 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HellsQ60848 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HellsQ60848 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HellsQ60848 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HellsQ60848 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HellsQ60848 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HellsQ60848 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HellsQ60848 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HellsQ60848 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HellsQ60848 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HellsQ60848 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HellsQ60848 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HellsQ60848 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HellsQ60848 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HellsQ60848 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms