Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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Rbm27Q5SFM8 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Rbm27Q5SFM8 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Rbm27Q5SFM8 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Rbm27Q5SFM8 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbm27Q5SFM8 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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