Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Peg10-203ENSMUST00000176551 6567 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC8.8□□□□□ -1
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Trappc1Q5NCF2 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
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Trappc1Q5NCF2 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
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Trappc1Q5NCF2 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
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Trappc1Q5NCF2 Cacna1c-209ENSMUST00000187386 6906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Trappc1Q5NCF2 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
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