Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Trim58Q5NCC9 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Trim58Q5NCC9 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Trim58Q5NCC9 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Trim58Q5NCC9 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Trim58Q5NCC9 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Trim58Q5NCC9 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Trim58Q5NCC9 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Trim58Q5NCC9 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim58Q5NCC9 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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