Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fam208bQ5DTT3 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.8 ms