Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTM8

Rnf20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, mousemouse

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Length 973 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf20Q5DTM8 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf20Q5DTM8 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf20Q5DTM8 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf20Q5DTM8 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf20Q5DTM8 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf20Q5DTM8 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf20Q5DTM8 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf20Q5DTM8 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf20Q5DTM8 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf20Q5DTM8 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf20Q5DTM8 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf20Q5DTM8 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf20Q5DTM8 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf20Q5DTM8 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf20Q5DTM8 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf20Q5DTM8 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf20Q5DTM8 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf20Q5DTM8 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf20Q5DTM8 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf20Q5DTM8 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf20Q5DTM8 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf20Q5DTM8 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf20Q5DTM8 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf20Q5DTM8 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf20Q5DTM8 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf20Q5DTM8 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf20Q5DTM8 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf20Q5DTM8 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf20Q5DTM8 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf20Q5DTM8 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf20Q5DTM8 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf20Q5DTM8 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf20Q5DTM8 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf20Q5DTM8 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf20Q5DTM8 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf20Q5DTM8 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf20Q5DTM8 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf20Q5DTM8 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf20Q5DTM8 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf20Q5DTM8 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf20Q5DTM8 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf20Q5DTM8 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf20Q5DTM8 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf20Q5DTM8 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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