Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

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Length 1,344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CenpjQ569L8 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CenpjQ569L8 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CenpjQ569L8 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CenpjQ569L8 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CenpjQ569L8 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CenpjQ569L8 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CenpjQ569L8 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CenpjQ569L8 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CenpjQ569L8 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CenpjQ569L8 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CenpjQ569L8 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CenpjQ569L8 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CenpjQ569L8 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CenpjQ569L8 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CenpjQ569L8 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CenpjQ569L8 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CenpjQ569L8 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CenpjQ569L8 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CenpjQ569L8 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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CenpjQ569L8 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CenpjQ569L8 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CenpjQ569L8 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CenpjQ569L8 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CenpjQ569L8 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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CenpjQ569L8 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CenpjQ569L8 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CenpjQ569L8 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CenpjQ569L8 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CenpjQ569L8 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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CenpjQ569L8 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CenpjQ569L8 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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CenpjQ569L8 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CenpjQ569L8 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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CenpjQ569L8 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CenpjQ569L8 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CenpjQ569L8 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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CenpjQ569L8 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CenpjQ569L8 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CenpjQ569L8 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CenpjQ569L8 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CenpjQ569L8 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CenpjQ569L8 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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CenpjQ569L8 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CenpjQ569L8 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CenpjQ569L8 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CenpjQ569L8 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CenpjQ569L8 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CenpjQ569L8 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CenpjQ569L8 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CenpjQ569L8 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CenpjQ569L8 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CenpjQ569L8 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CenpjQ569L8 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CenpjQ569L8 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CenpjQ569L8 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CenpjQ569L8 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CenpjQ569L8 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CenpjQ569L8 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CenpjQ569L8 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CenpjQ569L8 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CenpjQ569L8 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms