Protein–RNA interactions for Protein: Q505G4

Rtl6, Retrotransposon Gag-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl6Q505G4 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rtl6Q505G4 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms