Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shank3Q4ACU6 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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