Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Cldn16-201ENSMUST00000115302 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Lrrc43Q3V0L5 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Lrrc43Q3V0L5 Gm28269-201ENSMUST00000189511 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Lrrc43Q3V0L5 Fsip1-201ENSMUST00000028820 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Lrrc43Q3V0L5 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Lrrc43Q3V0L5 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Lrrc43Q3V0L5 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Lrrc43Q3V0L5 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Lrrc43Q3V0L5 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Lrrc43Q3V0L5 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Lrrc43Q3V0L5 Anxa10-202ENSMUST00000034054 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Milr1-201ENSMUST00000086353 1348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc43Q3V0L5 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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