Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc27Q3V036 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc27Q3V036 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc27Q3V036 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc27Q3V036 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc27Q3V036 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc27Q3V036 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc27Q3V036 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc27Q3V036 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc27Q3V036 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc27Q3V036 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc27Q3V036 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc27Q3V036 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc27Q3V036 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ccdc27Q3V036 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ccdc27Q3V036 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ccdc27Q3V036 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ccdc27Q3V036 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ccdc27Q3V036 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ccdc27Q3V036 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Ccdc27Q3V036 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Ccdc27Q3V036 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc27Q3V036 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms