Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC8.4□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms