Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR0

Shisa3, Protein shisa-3 homolog, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa3Q3UPR0 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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