Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sec31aQ3UPL0 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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