Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Puf60Q3UEB3 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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