Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trafd1Q3UDK1 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms