Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Parp8Q3UD82 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms