Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U595 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U595 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U595 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U595 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U595 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U595 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U595 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U595 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U595 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U595 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U595 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U595 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U595 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U595 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U595 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U595 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U595 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U595 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U595 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U595 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U595 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U595 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U595 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U595 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U595 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U595 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U595 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U595 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U595 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U595 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U595 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U595 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U595 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U595 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U595 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U595 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U595 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U595 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Q3U595 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U595 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U595 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U595 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U595 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U595 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U595 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U595 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U595 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U595 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U595 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U595 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U595 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U595 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U595 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U595 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U595 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U595 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U595 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U595 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U595 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U595 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U595 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U595 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U595 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U595 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U595 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U595 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U595 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U595 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U595 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U595 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U595 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U595 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U595 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U595 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U595 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U595 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U595 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U595 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U595 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U595 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U595 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U595 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Q3U595 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U595 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U595 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U595 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U595 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U595 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U595 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U595 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U595 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U595 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U595 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U595 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U595 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U595 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U595 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U595 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Q3U595 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms