Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccndbp1Q3TVC7 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccndbp1Q3TVC7 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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