Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Cers3Q1A3B0 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cers3Q1A3B0 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms