Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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