Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VgfQ0VGU4 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VgfQ0VGU4 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms